注冊醫療器械公司，辦理的流程與一般公司注冊基本上沒有什么不同。首先是要確定公司注冊資本、經營范圍、公司名稱、注冊地址、出資比例等，然后進行公司名稱的核準。核準通過之后，就可以攜帶相應的注冊材料，連同注冊申請一同提交（線上提交或者是現場窗口提交）。等待審核通過后，就可以領取營業執照。最后就是辦理刻章、開戶、申領發票、核定稅種等事項。
醫療器械公司注冊下來后，想要正常經營，還需要去做一件事請——辦理許可證。
根據辦理的許可證類型不同，需要符合的條件也不一樣。比如說申請《醫療器械經營企業許可證》應當同時具備下列條件:
1.具有與經營規模和經營范圍相適應的質量管理機構或者大專學歷以上質量管理人員兩個。質量管理人員應當具有國家認可的相關專業學歷或者職稱。
2.具有與經營規模和經營范圍相適應的相對獨立的經營場所。
3.具有與經營規模和經營范圍相適應的儲存條件，包括具有符合醫療器械產品特性要求的儲存設施、設備。
4.應當建立健全產品質量管理制度，包括采購、進貨驗收、倉儲保管、出庫復核、質量跟蹤制度和不良事件的報告制度等。
5.應當具備與其經營的醫療器械產品相適應的技術培訓和售后服務的能力，或者約定由第三方提供技術支持。
開辦第二、三類醫療器械經營企業，應向經營所在地食品藥品監管分局申請并提交以下資料:
(1)《深圳市醫療器械經營企業許可證申請表》;
(2)《醫療器械經營企業許可證申請材料登記表》;
(3)工商行政管理部門出具的企業名稱預核準證明文件或《營業執照》復印件(校驗原件);
(4)擬辦企業質量管理負責人的身份證、學歷或者職稱證明復印件及個人簡歷;
(5)擬辦企業質量管理人員的身份證、學歷或者職稱證明復印件;
(6)擬辦企業組織機構與職能或專職質量管理人員的職能;
(7)擬辦企業注冊地、倉庫的地理位置圖、平面圖(注明面積)、房屋產權證明或者租賃協議(附租賃房屋產權證明，下同)復印件;
(8)擬辦企業產品質量管理制度文件及儲存設施、設備目錄。
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